La FAMAF cuenta con cinco laboratorios que constituyen los espacios donde los investigadores pueden realizar sus prácticas y ensayos con el equipamiento necesario a tal fin. Dada la especificidad y complejidad tecnológica de cada una de estas dependencias, los laboratorios operan con personal altamente calificado, que además de las prestaciones de servicio producen material conceptual acerca de las propias experiencias de intervención.
Un elemento destacable es que no sólo trabajan para el personal científico de la Facultad u otros centros de investigación sino que también pueden brindar servicios para las demandas de la comunidad. Por contar con equipamientos con tecnología escasa en el país, forman parte de las redes de referencia a escala nacional.